膜结构积水一般都会自行排掉，但难免有一些死角仍有积水，如此就只能采用人工的方式来进行了。为了便于人工排除积水，膜结构在设计之初就应该要考虑到屋顶膜面的通道以及安全绳、固定索的连接件布局在哪个位置合适，然后以文档的形式做成操作指南供日后保养工人使用。

此外屋顶膜面雨后潮湿状态下会非常滑，必须要求工人穿软底鞋，使用安全绳。对于膜面的每个角落都要仔细检查清理，保持排水渠道的通畅。如果遭遇持续性降水时，要对大众关闭膜面的覆盖空间并采取措施避免新的积水。